Châu tự trị dân tộc Cáp Nê, Di Hồng Hà quản lý các đơn vị cấp huyện sau:

Các quận nội thành

Quận: Châu tự trị này không có quận nội thành.

Các thị xã

Châu tự trị này có các huyện cấp thị sau:

• Thị xã Mông Tự (蒙自市)
• Thị xã Cá Cựu (个旧市)
• Thị xã Khai Viễn (开远市)
• Thị xã Di Lặc (弥勒市)

Các huyện

Châu tự trị này có các huyện sau:

• Lục Xuân (绿春)
• Kiến Thủy (建水)
• Thạch Bình (石屏)
• Lô Tây (泸西)
• Nguyên Dương (元阳)
• Hồng Hà (红河)
• Huyện tự trị dân tộc Miêu, Dao, Thái Kim Bình (金平苗族瑶族傣族自治县)
• Huyện tự trị dân tộc Dao Hà Khẩu (河口瑶族自治县)
• Huyện tự trị dân tộc Miêu Bình Biên (屏边苗族自治县)